假单胞菌反式氯双烯内酯异构酶基因克隆和序列分析

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篇1：假单胞菌反式氯双烯内酯异构酶基因克隆和序列分析

假单胞菌反式氯双烯内酯异构酶基因克隆和序列分析

从土壤中分离得到一株降解2,4-二氯酚能力较强的假单胞菌菌株GT241-1,从该菌株中克隆出参与降解2,4-二氯酚的反式氯双烯内酯异构酶基因(dcpE).克隆策略是采用Southern杂交对其邻近基因进行定位后构建基因组文库,再用斑点杂交从基因文库中筛选目的`转化子.经序列测定得知,dcpE基因编码区1 062 bp.核苷酸和推测的编码氨基酸序列分析表明,dcpE与已在GenBank登记的相关基因有一定的差异.图5表1参12

作 者：钟文辉 何国庆 孙明 冯孝善 喻子牛 ZHONG Wenhui HE Guoqing SUN Ming FENG Xiaoshan YU Ziniu  作者单位：钟文辉,ZHONG Wenhui(南京师范大学化学与环境科学学院,南京,210097)

何国庆,HE Guoqing(浙江大学生物系统工程与食品科学学院,杭州,310029)

孙明,喻子牛,SUN Ming,YU Ziniu(华中农业大学生命科学技术学院,武汉,430070)

冯孝善,FENG Xiaoshan(浙江大学环境与资源学院,杭州,310029)

刊 名：应用与环境生物学报  ISTIC PKU英文刊名：CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY 年，卷(期)： 12(5) 分类号：Q93 关键词：假单胞菌   2,4-二氯酚   反式氯双烯内酯异构酶基因   基因克隆  

篇2：紫花苜蓿几丁质酶基因MsChiⅣ克隆及序列分析

紫花苜蓿几丁质酶基因MsChiⅣ克隆及序列分析

本研究根据截形苜蓿(Medicago truncatula)根部的'几丁质酶基因保守序列(GenBank登录号:AF167328)设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法得到了紫花苜蓿(Medicago Sativa L.)根部几丁质酶基因保守序列.根据得到的保守序列设计3'端和5'端特异引物,分别从3'端和5'端扩增延长该片段,最后通过序列拼接获得紫花苜蓿根部一种几丁质酶基因的全长cDNA序列,命名为MsChiⅣ(GenBank登录号:FJ487629).MsChiⅣ基因全长为1 025 bp,开放性阅读框全长为849 bp,编码282个氨基酸,分子量为30.5 kD,预测等电点为4.66,其结构包括信号肽、几丁质结合区、糖苷水解酶区,为Ⅳ类几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,在氨基酸水平上与截形苜蓿几丁质酶蛋白同源性最高,达到98%.蛋白结构分析表明该基因编码蛋白为非跨膜蛋白,存在于细胞质中.

作 者：王步云 李聪 王涌鑫 关宁 苗丽宏 Wang Buyun Li Cong Wang Yongxin Guan Ning Miao Lihong  作者单位：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,牧草遗传育种研究室,北京,100193 刊 名：分子植物育种 英文刊名：MOLECULAR PLANT BREEDING 年，卷(期)： 7(2) 分类号：S6 关键词：几丁质酶基因   紫花苜蓿   克隆   分析  

篇3：植物乳杆菌共轭亚油酸异构酶基因的克隆、序列分析及重组表达

植物乳杆菌共轭亚油酸异构酶基因的克隆、序列分析及重组表达

利用MRS培养基培养植物乳杆菌AS1.555,收集菌体后提取总DNA,用PCR技术扩增其亚油酸异构酶基因,克隆到pQE30质粒载体上,并进行测序.测序结果表明,扩增DNA全长1710 bp,编码569个氨基酸,分子量为64.7 ku.经同源性比较,此核酸序列与罗伊氏乳杆菌、短双歧杆菌、疮疱丙酸杆菌亚油酸异构酶基因核苷酸序列差别较大,推测此基因的.来源与上述菌种不同.

作 者：相丽新 曹健 王红军 尹艳丽 王育军 于海东 张琳 董理 XIANG Li-xin CAO Jian WANG Hong-jun YIN Yan-li WANG Yu-jun YU Hai-dong ZHANG Lin DONG Li  作者单位：河南工业大学生物工程学院,河南,郑州,450001 刊 名：化学与生物工程  ISTIC英文刊名：CHEMISTRY & BIOENGINEERING 年，卷(期)： 24(6) 分类号：Q78 关键词：植物乳杆菌   亚油酸异构酶基因   克隆   序列分析  

篇4：利用IRS-PCR技术分析金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌基因多态性

利用IRS-PCR技术分析金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌基因多态性

目的:利用IRS-PCR技术分析院内感染金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌基因组多态性,以期进行更加行之有效的院内感染监控.方法:收集重症监护病房中引起院内感染的.金黄色葡萄球菌23株和铜绿假单胞菌10株;利用IRS-PCR方法进行基因组多态性分析.结果:金黄色葡萄球菌表现明显同源性,与质控菌株显著不同;同病房不同来源铜绿假单胞菌则呈现不同型别多态性特征.结论:重症监护病房短期内存在金黄色葡萄球菌暴发流行;利用IRS-PCR技术进行细菌多态性分析快速、准确、可靠,而且可用于不同菌种,是用于流行病学监测的有效方法.

作 者：叶杨芹 应春妹 杨海慧 汪雅萍 张灏F 于嘉屏 Ye Yang-qin Ying Chun-mei Yang Hai-hui Wang Ya-ping Zhang Hao-min Yu Jia-ping  作者单位：上海交通大学医学院附属仁济医院检验科,上海,27 刊 名：中国卫生检验杂志  ISTIC英文刊名：CHINESE JOURNAL OF HEALTH LABORATORY TECHNOLOGY 年，卷(期)：2007 17(7) 分类号：Q7 关键词：IRS-PCR   基因多态性  

篇5：玫瑰微球菌海藻糖合成相关酶基因的克隆和序列分析

玫瑰微球菌海藻糖合成相关酶基因的克隆和序列分析

从玫瑰微球菌QS412中克隆出海藻糖生成相关酶-麦芽寡糖基海藻糖基水解酶的基因treZ,测定了其核苷酸序列并进行了表达.treZ编码的蛋白质有624个氨基酸,分子量为68kD.它们与已报道的其他微生物的海藻糖生成相关酶的基因进行同源性比较,treZ的同源性分别为33.0%(耐放射异常球菌)、10.1%(硫矿硫化叶菌KM1)、51.9%(节杆菌Q36)、52.8%(根瘤菌M11)和48.5%(短杆菌).经过氨基酸序列比较分析还发现,所有的`海藻糖生成相关酶都含有糖苷酶家族13个中几个高度保守的a-淀粉酶催化活性区,推测这些海藻糖生成相关酶都可能有着共同的进化来源.

作 者：陆阳 袁其朋 LU Yang YUAN Qi-peng  作者单位：北京化工大学生命科学与技术学院,北京,100029 刊 名：北京化工大学学报（自然科学版）  ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OF CHEMICAL TECHNOLOGY(NATURAL SCIENCE EDITION) 年，卷(期)：2006 33(2) 分类号：Q785 Q786 关键词：玫瑰微球菌   海藻糖   基因克隆   序列分析  

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